根據(jù)基金會管理條例，基金會的設立由民政部門審核，具體的申請機構是地方性的民政部門還是國務院民政部門與設立的慈善基金會的性質，規(guī)模等方面相關。像全國性公募基金會，原始基金超過2000萬元的非公募基金會，法人代表為非內地居民的基金會等等情況，需要向國務院民政部門遞交申請。
設立一家非公募基金會，根據(jù)《基金會管理條例》，需要雙重管理：
不僅需要到民政部進行登記（實為審批），還需要掛靠一家慈善領域相關的“業(yè)務主管單位”（一般為機關和黨政部門，業(yè)界稱之為“婆婆”）。
由于找不到可以掛靠的業(yè)務主管單位，一些民間慈善組織無奈采取公司的形式，以營利組織的形式從事慈善活動，但在財務和稅務上成本很高。
設立基金會，應當具備下列條件：
（一）為特定的公益目的而設立；
（二）全國性公募基金會的原始基金不低于800萬元人民幣，地方性公募基金會的原始基金不低于400萬元人民幣，非公募基金會的原始基金不低于200萬元人民幣；原始基金必須為到賬貨幣資金；
（三）有規(guī)范的名稱、章程、組織機構以及與其開展活動相適應的專職工作人員；
（四）有固定的住所；
（五）能夠獨立承擔民事責任。
建立一家基金會需要遵循以下步驟：
1、決定基金會的宗旨。每個基金會應該有一個表述存在原因的落在紙面的宗旨。
2、組建理事會。初始的理事會將通過規(guī)劃和籌資幫助工作團隊把基金會背后的想法變成現(xiàn)實。隨著基金會的發(fā)展成熟，理事會的性質和組成人員也會改變。
3、起草章程。章程是理事會的運營規(guī)則，應該在基金會的早期發(fā)展過程中由理事會通過。
4、準備注冊需要的原始基金，原始基金必須為到賬貨幣資金。
5、選擇一個業(yè)務主管部門，獲得業(yè)務主管單位同意設立的文件。根據(jù)最新的政策，一些地區(qū)不需要再找業(yè)務主管單位。
6、尋找辦公場所，招募合適的工作人員。
7、填寫法人登記申請書，確定在哪個民政部門登記，向民政部門提交法人登記申請書。國務院民政部門和省、自治區(qū)、直轄市人民政府民政部門是基金會的登記管理機關。
8、進行戰(zhàn)略規(guī)劃。戰(zhàn)略規(guī)劃表述了基金會潛力的愿景。戰(zhàn)略規(guī)劃應該描述出實現(xiàn)這個潛力所必需經(jīng)過的步驟，決定要實現(xiàn)這個機會需要什么樣的工作團隊，確定至少一年內的項目和運作優(yōu)先事項。
9、制定預算計劃和資源開發(fā)計劃。財務監(jiān)管和資源開發(fā)（如籌資、獲得收入、吸收會員會費）是理事會的最重要職責。實現(xiàn)戰(zhàn)略規(guī)劃需要的資源必須在預算和財務計劃中描述清楚。
10、建立基金會正式文件的存檔體系。登記文件、理事會會議記錄、財務報告和其他正式文件都應該妥善存檔。
11、建立會計體系。基金會財務的盡職管理需要一套已經(jīng)確立的可以滿足現(xiàn)狀和未來需求的會計體系。
12、提交稅收減免資格申請。
